尽管粪菌移植对复发性艰难梭菌具有高度有效的治疗效果，但迄今为止，这种细菌疗法在治疗与微生物菌群失调相关的慢性疾病方面的功效仍然中等，且反应混合。这些变化可能归因于缺乏与疾病（如肠易激综合征）相关的一致的微生物特征。但是，2019年的一项大型随机安慰剂对照研究表明，使用“超级供体”进行的粪菌移植是一种有效且耐受良好的肠易激综合征治疗方法，可产生较高的临床反应率和明显的症状改善。

在一项小型的假对照试验中，患有难治性肠易激综合征的患者在粪菌移植后出现了症状改善。请注意，效果在1年的时间内逐渐减弱，但可以通过第二次粪菌移植在某些初始响应者中挽救。

在小型假对照试验中，患有难治性腹泻或混合症状的难治性肠易激综合征患者在粪菌移植后症状缓解。

Holvoet及其同事指出，准备供体大便可能是粪菌移植疗效的重要因素。他们写道：“来自我们自己实验室的确实未公开的数据表明，冰冻的粪便与多样性降低有关，并且可能解释了使用冰冻的粪菌移植胶囊进行的研究缺乏效果。”

他们补充说：“由于研究设计的原因，我们无法研究在安慰剂治疗的应答??者中重新设定（安慰剂治疗）微生物群的效果，但是在以后的研究中也应对此进行研究。”

他们写道，对于下一步，“需要进行研究以确定哪些患者最有可能做出反应以及粪便中哪些成分对治疗产生影响。”

挪威卑尔根大学的胃肠病学家Magdy El-Salhy医师对MedPage Today说，这项研究“支持捐赠者的选择对于粪菌移植的结果很重要的观点，并证实了粪菌移植在上消化道的管理道来是成功的。”

他警告说，但是，该研究仅限于腹泻为主和混合型肠易激综合征的肠易激综合征患者，队列规模相对较小，并且缺乏先前的功效计算。“此外，尽管较早的对上消化道或下消化道进行粪菌移植的研究表明，增加移植剂量可增加反应（30克对60克），但该研究的作者并未阐明他们使用的移植剂量，仅提及注入300毫升混合并过滤的供体粪便，”未参与研究的El-Salhy继续说道。

他还对研究选择供者的较窄标准持怀疑态度。在先前的研究中，El-Salhy及其同事根据可能对肠道菌群产生积极影响的多种因素选择了供体。选定的捐献者是一个健康，无毒品，瘦弱，运动的年轻男性，通过阴道分娩出生，母乳喂养，一生中仅经历过三个抗生素疗程的历史，并且饮食多样，并补充蛋白质，维生素，纤维和矿物质。他normobiotic，有一个特定的微生物特征在39 14的细菌指标与预期的正常健康丰富的偏离，使得他的粪便比平均水平更丰富的乳酸菌，毛螺和疣微菌门，和降低志贺氏菌和大肠埃希氏菌。

“尽管这项研究的结果很有趣，但仍需要运用Segal等人的建议进行进一步的研究，特别是那些有关选择供体，粪菌移植给药的剂量和途径以及肠易激综合征患者特征的建议， “ 他说。