菌群移植的成功率因病情而异，并且目前尚没有统一的标准来衡量其成功率。然而，从现有数据来看，菌群移植通常具有较高的成功率。

　　对于慢性肠道感染的治疗，研究表明，菌群移植的成功率可达90%以上。例如，对于由难治性梭菌引起的严重腹泻，多项研究表明菌群移植显著缩短了恢复时间，而且成功率非常高。在治疗肠胃道炎症性疾病(如克罗恩病)方面，菌群移植成功率在60%~80%之间。

　　此外，菌群移植在自闭症的治疗方面也有成功案例。例如，一名6岁的自闭症患儿经过菌群移植后，自闭症症状明显改善。

　　总的来说，菌群移植的成功率取决于病情和治疗方案等多个因素，建议在医生的指导下进行选择和评估。