肠道菌群失调症可以通过多种检查来确诊，其中包括：

　　体格检查：通过对患者全身的检查，如体温、呼吸、脉搏等，可以初步了解患者的一般情况，有助于诊断。

　　粪便检查：这是肠道菌群失调症的重要检查手段。可以通过大便隐血试验、涂片查白细胞、红细胞、未消化的食物等来判断是否伴有肠道感染及消化道出血。涂片查粪便细菌、真菌及大便细菌培养可以分析菌群类型及数量，从而了解肠道菌群失调的情况。

　　血液检查：包括血常规、血液电解质、肝肾功能等检验，有助于肠道菌群失调症的鉴别诊断。

　　内镜检查：包括胃镜、结肠镜，必要时行胶囊内镜等检查，可以直观观察消化道情况，对于肠道菌群失调症有重要的诊断价值。内镜下常可观察到肠黏膜呈弥漫性充血、水肿、血管分支模糊不清或消失，同时可用内镜取活检并吸收肠液进行检验和培养，明确菌群类型及分布。

　　综上，粪便检查和内镜检查是提示肠道菌群失调的主要检查手段。当怀疑自己存在肠道菌群失调且症状严重时，应及时就医，接受专业医生的检查和治疗。