肠道菌群移植通常需要住院2~3天，但也可能需要5~7天或更长时间，这取决于患者的具体情况。如果患者是打算口服粪菌胶囊，这个情况，有的患者是可以不住院的。

　　在做肠道菌群移植改善后，可能会对患者身体造成一定的影响，也会导致身体出现不适的情况。一般在身体体质比较好的情况下，需要2~3天就可以恢复，而有的人群可能身体体质比较差，需要的时间要长一些，大概需要5~7天的时间才可以恢复。

　　建议做肠道菌群移植的患者，一定要在医生指导下制定健康管理方案，有助于菌群在肠道内生殖，以免发生副作用而影响预后。