慢性疲劳综合征(Chronic Fatigue Syndrome，CFS，又称肌痛性脑脊髓炎 / 慢性疲劳综合征，ME/CFS)是一种以 “持续性、原因不明的疲劳” 为核心特征的复杂疾病，患者常伴随睡眠障碍、认知功能下降、肌肉关节疼痛、胃肠道不适等症状，且症状持续 6 个月以上，严重影响日常生活。目前，CFS 的病因尚未完全明确，主流研究认为其与免疫系统紊乱、神经内分泌失调、肠道菌群失衡等多种因素相关，其中 “肠道菌群 - 肠 - 脑轴” 的异常被视为关键机制之一 —— 肠道菌群通过代谢产物(如短链脂肪酸、色氨酸代谢物)、免疫调节信号等途径，影响中枢神经系统功能，进而参与疲劳、情绪、认知等症状的发生。

　　从理论机制来看，菌群移植对 CFS 存在潜在益处。一方面，多项研究发现 CFS 患者存在显著的肠道菌群失衡，例如双歧杆菌、乳杆菌等有益菌数量减少，肠杆菌科、变形菌门等潜在有害菌比例升高，这种失衡可能通过 “肠 - 脑轴” 加剧炎症反应(如促炎细胞因子水平升高)、干扰神经递质合成(如血清素前体生成减少)，最终诱发或加重疲劳、睡眠障碍等症状;另一方面，菌群移植可直接补充有益菌、抑制有害菌，修复肠道屏障功能，减少内毒素入血(降低 “肠漏” 引发的全身性炎症)，同时调节免疫紊乱，从源头改善 “肠 - 脑轴” 的异常信号传导，为缓解 CFS 症状提供可能。

　　未来，菌群移植治疗 CFS 的研究需聚焦三个方向：一是开展大样本、多中心的随机对照试验，通过 “安慰剂对照”“不同供体对比” 等设计，明确菌群移植的真实疗效;二是探索 “精准菌群移植”，通过宏基因组测序等技术分析 CFS 患者的肠道菌群特征，实现 “个性化供体匹配”;三是深入研究 “菌群 - 肠 - 脑轴” 在 CFS 中的具体机制，找到菌群移植起效的 “关键靶点”(如特定代谢产物、菌群种类)，为优化治疗方案提供理论依据。只有解决这些问题，菌群移植才有可能从 “潜在手段” 转变为 CFS 的 “有效治疗选择”。​