菌群移植，也称为粪便微生物移植(Fecal Microbiota Transplantation, FMT)，是一种将健康捐赠者的粪便中的微生物菌群转移到受捐者体内的医疗程序，目的在于重建受捐者肠道内的正常微生物环境。

　　这种治疗方法主要用于治疗由抗生素难以根除的艰难梭菌(Clostridium difficile)感染引起的慢性腹泻和肠炎等疾病。艰难梭菌感染通常发生在抗生素治疗之后，因为抗生素会破坏正常的肠道菌群，从而允许这种通常存在于肠道中的细菌过度增长并产生毒素，导致症状。

　　除了治疗C. difficile感染，菌群移植还被研究用于治疗其他一些肠道疾病，如炎症性肠病(如克罗恩病和溃疡性结肠炎)、肥胖、代谢综合征和某些自身免疫性疾病，但这些应用尚处于研究阶段，尚未得到广泛的医学界认可。

　　菌群移植的过程通常包括以下步骤：

　　筛选捐赠者：捐赠者需要经过严格的筛选，以确保其粪便中不含有病原体和其他有害微生物。

　　粪便处理：捐赠者的粪便会在实验室中处理，去除大部分杂质，并提取其中的微生物。

　　粪菌移植：处理后的微生物菌群可以通过不同的途径移植给受捐者，包括灌肠、胶囊(口服)、鼻饲管或结肠镜等。 观察和随访：

　　粪菌移植后，医生会密切观察受捐者的反应和健康状况，并进行必要的随访。

　　菌群移植是一个相对新颖的治疗方法，尽管在治疗某些疾病方面显示出了潜力，但它仍然需要更多的研究来确定其安全性、有效性和最佳实践指南。