正常菌群是指存在于人体内的微生物：人体存在不同种类和数量的微生物，它们通常对人体无害。但一旦遭到破坏，就会引起菌群失调症状。顾名思义，正常菌群是日常地生活在人体中的细菌。人体中几乎无处不在。

　　特别是，暴露于外部环境的部分，如皮肤、嘴、眼睛、鼻子、气道、尿路、肛门和女性生殖器，总是有细菌依附着。人在母亲子宫里时，处于无菌状态，但在分娩的同时暴露在细菌中，细菌在体内增加。幽门螺杆菌是这些正常菌群中的一种。

　　根据美国布朗大学的苏珊·休斯副教授的分析，从迄今为止发现的人体正常菌群所在的人体部位来看，在舌头上有7947种，喉咙有4154种，在耳朵的背面有2359种，在大肠里有33627种，在女性生殖器的入口有2062种。

　　从嘴到肛门的肠道中，有大量的细菌存在，如帮助消化和免疫的大肠杆菌、乳酸菌、酪酸菌(又称丁酸菌——译者注)，以及产生臭屁的韦氏梭菌(产气荚膜梭菌)等。从喉咙到肺部的气管道存在肺炎球菌、肺炎杆菌。在皮肤上，存在引起青春痘(痤疮)的痤疮丙酸杆菌，引发头皮屑的马拉色菌，引起脚气病的白癣菌。在女性生殖器常驻的细菌中，具有代表性的有念珠菌和双歧杆菌等。

　　据估计，在人嘴里有100亿个、皮肤上有1万亿个以上的细菌存在，在人体中，其总数是构成人体的细胞数量的10倍以上，即数百万亿个。正常菌群的总重量达1300克，这相当于大脑的重量。

　　近年来的基因破译解明，肠道中的微生物群总共有330万个基因，相当于人类基因的100倍。其中一部分以各种各样的形式发挥着对我们有益的作用。

　　共存共荣的正常菌群

　　正常菌群在体内相互排斥和共生，同时保持一定的和谐，并共存共荣。动物与正常菌群建立了密切的关系。特别是，在100兆个细菌常驻的肠道内，比拟成一个惊人地发达的植物生态系的话，可被称为“肠道细菌花圃”。因为大便的一半左右是肠道细菌或其尸体，可见其数量也不是一般般的。

　　没有大肠杆菌，我们就无法生存。它有助于分解多糖和淀粉，并产生与脂肪的积累有关的维生素和激素。它也是免疫系统发育所必需的，且可阻止有害细菌的暴发性繁殖。

　　全世界正在研究“便微生物移植”，即将健康人的肠道细菌移植到肠道疾病患者体内，并开发由肠道细菌制成的治疗药物。据说，对治疗恶性肠炎有一定的效果，如溃疡性结肠炎和过敏性肠综合征等。

　　人和正常菌群并不总是和平共处。这些正常菌群在本来的寄宿部位生活，在人体健康的状态下，几乎对人不造成伤害。可是，即使在肠道中没有任何坏处的大肠杆菌，当进入膀胱部位时，也会引起膀胱炎。就是说，大肠杆菌具有一个巧妙的调和机理，只要生活在肠道中，就不被视为异物。

　　另外，当不熟悉的“野生细菌”进入人体或人体失去免疫力并陷入无防护状态时，某些正常菌群就会突然露出凶相。这些平时看似无害却在突然间变得令人可怕的细菌被称为机会致病菌。

　　当免疫力较弱的老年人感染流感时，呼吸道中的细菌会导致肺炎。而长期服用抗癌药物或抗生素的患者经常被发现有正常菌群异常生长的情况。艾滋病人特有的肺囊虫肺炎就是健康状态下无害的正常菌群引起的。

　　每5个日本人中有超过1人会患“过敏性皮肤炎”。关于其原因有各种各样的说法。有种猜测是，其与皮肤正常菌群中的一种细菌产生的蛋白质有关联。此外，实验已经确认，抗生素杀死有益的正常菌群会突然让人发胖。在过去的半个世纪里，美国肥胖人口增加了3倍。一些研究人员声称，除了过量摄入碳水化合物和脂质外，还与抗生素有关。

　　近年来，发现一些有趣的事情。美国俄克拉何马大学塞西尔·刘易斯教授的研究小组在调查智利沙漠中发现的木乃伊的肠道细菌。其结果表明，8000年至1400年前的人体中的正常菌群与现在非洲农村地区的人们非常相似，却与住在都市的现代人有很大的区别。这说明，在过去每个人都有类似的正常菌群，但是，因药物和饮食，这些正常菌群已经发生了改变。